Có những tên gia tộc vào thời cổ đại được gọi là Uji-na (氏名 (thị danh), Uji-na?) hoặc Honsei (本姓 (bản tính), Honsei?).

Hoàng gia

• Hoàng tộc - có thể là hậu duệ của Oa Ngũ vương và chính thể Yamato trong thời kỳ Kofun. Các Thiên hoàng của gia tộc này và các thành viên gia tộc khác không có tên gia tộc, nhưng được gọi là "vương thị" (王氏) nếu cần thiết.

Bốn đại gia tộc

Genpeitōkitsu (源平藤橘 (Nguyên Bình Đằng Quất), Genpeitōkitsu?), bốn đại gia tộc của Nhật Bản:

• Gia tộc Minamoto (源氏) - còn được biết với tên gọi Genji; gồm 21 chi tộc nhánh của Hoàng thất.
  • Daigo Genji (醍醐源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Daigo.
  • Go-Daigo Genji (後醍醐源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Go-Daigo.
  • Go-Fukakusa Genji (後深草源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Go-Fukakusa.
  • Go-Nijō Genji (後二条源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Go-Nijō.
  • Go-Saga Genji (後嵯峨源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Go-Saga.
  • Go-Sanjō Genji (後三条源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Go-Sanjō.
  • Go-Shirakawa Genji (後白河源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Go-Shirakawa.
  • Juntoku Genji (順徳源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Juntoku.
  • Kameyama Genji (亀山源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Kameyama.
  • Kazan Genji (花山源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Kazan.
  • Kōkō Genji (光孝源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Kōkō.Mon của Murakami Genji
  • Montoku Genji (文徳源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Montoku.
  • Murakami Genji (村上源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Murakami.
  • Nimmyō Genji (仁明源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Nimmyō.
  • Ōgimachi Genji (正親町源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Ōgimachi.
  • Reizei Genji (冷泉源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Reizei.
  • Saga Genji (嵯峨源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Saga.
  • Sanjō Genji (三条源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Sanjō.
  • Seiwa Genji (清和源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Seiwa; là gốc gác của nhiều gia tộc samurai.
    • Kawachi Genji (河内源氏) - cũng được biết với tên gọi Genke; là hậu duệ của Minamoto no Yorinobu; là gốc gác của các gia tộc Hitachi Genji (常陸源氏), Ishikawa Genji (石川源氏) và Kai Genji (甲斐源氏); nổi tiếng với ba shogun của Mạc phủ Kamakura.
    • Settsu Genji (摂津源氏) - hậu duệ của Minamoto no Yorimitsu; là gốc gác của các gia tộc Tada Genji (多田源氏), Mino Genji (美濃源氏) và Shinano Genji (信濃源氏).
    • Yamato Genji (大和源氏) - hậu duệ của Minamoto no Yorichika.
  • Uda Genji (宇多源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Uda; là gốc gác của gia tộc Ōmi Genji (近江源氏).
  • Yōzei Genji (陽成源氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Yōzei.

• Gia tộc Taira (平氏) - cũng được biết đến là Heishi; 4 chi tộc nhánh của Hoàng gia Nhật Bản.
  • Kammu Heishi (桓武平氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Kammu, nổi tiếng với Taira no Masakado.
    • Bandō 8 Heishi (坂東八平氏) - hậu duệ của Taira no Yoshifumi.
    • Ise Heishi (伊勢平氏) - cũng được biết đến như Heike; hậu duệ của Taira no Korehira, nổi tiếng với Taira no Kiyomori.
  • Kōkō Heishi (光孝平氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Kōkō.
  • Montoku Heishi (文徳平氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Montoku.
  • Nimmyō Heishi (仁明平氏) - hậu duệ của Thiên hoàng Nimmyō.
• Gia tộc Fujiwara (藤原氏) - hậu duệ của Fujiwara no Kamatari.
  • 4 dòng họ của Fujiwara (藤原四家) - hậu duệ của bốn con trai của Fujiwara no Fuhito.
    • Fujiwara Hokke (藤原北家) - dòng họ phía Bắc; hậu duệ của Fujiwara no Fusasaki.
    • Fujiwara Kyōke (藤原京家) - hậu duệ của Fujiwara no Maro.
    • Fujiwara Nanke (藤原南家) - dòng họ phía Nam; hậu duệ của Fujiwara no Muchimaro.
    • Fujiwara Shikike (藤原式家) - hậu duệ của Fujiwara no Umakai.
  • Gia tộc Bắc Fujiwara (奥州藤原氏) - cũng được biết đến như gia tộc Ōshū Fujiwara; hậu duệ của Fujiwara no Hidesato.
• Gia tộc Tachibana (橘氏) - hậu duệ của Hoàng tử Naniwa-Ō, con trai của hoàng tử Shōtoku-Taishi (572-621), con trai thứ của Thiên hoàng Yōmei, không trực tiếp liên quan đến gia tộc phong kiến Tachibana (立花氏)